כלי ציפורניים מחוטאים בדרך כלל נשארים סטריליים למשך כשבוע, עם מקסימום שבועיים. משך הזמן המדויק תלוי בשיטת החיטוי, בסביבת האחסון ובסוג הכלי.
על פי נוהלי ההפעלה הסטנדרטיים, אם הכלים מושרים באלכוהול 75% למשך 10 דקות או נחשפים לאור אולטרה סגול למשך 30 דקות, ולאחר מכן מאוחסנים בארון חיטוי ייעודי יבש, אטום ועמיד בפני אור- או שקית סטרילית, בדרך כלל הם יכולים לשמור על מצב חיטוי יעיל למשך כ-7 ימים. חלק ממכוני הציפורניים המנוהלים בקפדנות יסמנו את תאריך החיטוי ויקבעו שכלים שלא נעשה בהם שימוש במשך יותר מ-7 ימים חייבים לעבור חיטוי מחדש.-
עם זאת, אם מאוחסנים בסביבה לחה,-בטמפרטורה גבוהה או פתוחה, או אם שימוש תכוף מוביל לזיהום, אפקט החיטוי עלול להפוך לבלתי יעיל תוך 24-48 שעות. במיוחד במצבים שבהם מספר אנשים חולקים את אותו החלל או שבהם הסביבה עשירה בחיידקים, פטריות או חיידקים יכולים בקלות-לגדול מחדש על פני הכלי.
